Embora a Oracle tenha comprado o java, ele ainda é gratuito. 
O NetBeans é bem didático para quem quer aprender java, mas pode criar um mau hábito por ter todas as ferramentas já disponíveis para uso. 
Outro seria o uso do Eclipse, bem mais robusto e com mais recursos do que o NetBeans, além de proporcionar uma programação mais limpa. Mas, em compensação, é mais complicado de se aprender. 
Eu aprendi a programar em Java com o Eclipse em 2007. Recentemente um amigo me pediu que fizesse um programa pra ele mas que precisava ser feito com o NetBeans, que eu nunca havia usado. 
Fiz o download e o instalei. 
Em um fim de semana aprendi a trabalhar com o NetBeans e entreguei o programa funcionando, com acesso a banco de dados e tudo. 
Resumindo: se manjar de Eclipse, o resto é resto. 
Abraços! ;D